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NGS de alta profundidad. Mutaciones somáticas en PIK3CA y síndromes de sobrecrecimiento

Cumplimos 20 años de retos y avances increíbles, esto no habría sido posible sin la ayuda de todos los que creyeron en nosotros, a todos vosotros, ¡gracias!

Mié, 01/02/2017 - 11:38 -- Genetaq

Es de sobra conocido que la secuenciación de nueva generación ha revolucionado la genética clínica gracias a sus grandes ventajas a la hora del estudio de mutaciones. Uno de los usos más expandidos de estas técnicas ha sido en el estudio de alteraciones somáticas postzigóticas asociadas con anormalidades fenotípicas congénitas. De los multitudinarios estudios de estas mutaciones somáticas causantes de enfermedad, el que aquí nos ocupa se basa en el análisis de la ruta de transducción vía PI3K/AKT/mTOR, incluyendo PIK3CA, asociada a síndrome de sobrecrecimiento y malformaciones vasculares.

En un estudio publicado en el último número de Clinical Genetics, Hucthagowder y colaboradores describen como, utilizando estudios de secuenciación de alta profundidad, pueden detectar variantes somáticas de muy baja frecuencia en el gen PIK3CA. En estos estudios realizan un paso previo de captura de híbridos, tras el cual secuencian el gen por técnicas NGS para la detección de estas variantes de baja frecuencia. Tras un análisis bioinformático exhaustivo, consiguieron detectar variantes con una presencia menor del 10% en el total de secuencias analizadas del gen PIK3CA, con una fiabilidad de resultados mayor del 99%.

El estudio lo realizaron en pacientes que presentaban fenotipo clínico de sobrecrecimiento y malformaciones vasculares, y tras estos estudios de secuenciación, los autores pudieron establecer una relación entre la severidad del fenotipo observado y la frecuencia de estas mutaciones. A su vez, los autores pudieron documentar dos mutaciones patogénicas en el gen PIK3CA no descritas antes en bibliografía.

Los estudios de NGS, junto con los cada vez más exhaustivos análisis bioinformáticos, construyen una herramienta de muy alto potencial para el descubrimiento de mutaciones somáticas de baja frecuencia, y ayudan a dar una explicación genética a patologías que presentan distintos grados de severidad.

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