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Frecuencia de las variantes genéticas asociadas con miocardiopatía arritmogénica del ventrículo derecho en la base de datos Genome Aggregation Database

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Mié, 05/09/2018 - 16:56 -- Genetaq

La miocardiopatía arritmogénica del ventrículo derecho (ARVC,de sus siglas en inglés Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy) es una enfermedad genética rara del músculo cardiaco, la cual es la mayor causa de arritmias potencialmente mortales y muerte cardiaca súbita en los adultos jóvenes y atletas. UN diagnóstico temprano y preciso puede ser crucial en el manejo efectivo de la ARVC y la prevención de la muerte súbita.

En el estudio llevado a cabo por Hall y col., las variantes ARVC previamente identificadas clasificadas como patogénicas o inciertas (http://www.arvcdatabase.info/), en los cinco genes más comúnmente mutados: PKP2, DSP, DSG2, DSC2 yJUP (40–50% casos ARVC), fueron buscadas en la base de datos en la población de 138.632 individuos no relacionados de la base de datos Genome Aggregation Database (gnomAD). Una MAF de 0.001 fue usada para definir las variantes como raras o comunes.

Los datos de gnomAD contenían 117/364 (32%) de las variantes patogénicas previamente reportadas como patogénicas y 152/266 (57%) de las inciertas. El análisis cross-ethnic de MAF reveló que variantes previamente clasificadas como  patogénicas y 57 inciertas eran comunes (MAF ≥ 0.001) en al menos una población étnica gnomAD y, por lo tanto, poco problablemente causantes de ARVC.

Tras aplicar el análisis MAF la frecuencia global de variantes patogénicas ARVC en gnomAD fue de uno en 257 individuos, pero un cut-off más restrictivo (MAF ≥ 0.0001) dio una frecuencia de uno en 845 individuos, más cercana a la frecuencia fenotípica estimada de la enfermedad.

Este estudio demuestra que el análisis de los datos de secuenciación de diferentes grupos étnicos puede mejorar significativamente la interpretación de las variantes. La mayor frecuencia de lo esperado de variantes ARVC sugiere que una proporción de variantes causantes de ARVC puede ser más clasificada, lo que implica penetrancia reducida de algunas variantes y/o una etiología poligénica de ARVC

 

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